猪伪狂犬病病毒山西株胸苷激酶基因序列分析

• 作 者: 樊振华 孟帆 吴忻 刘文俊 姚敬明 王娟萍 韩一
• 机 构: 山西省农业科学院畜牧兽医研究所; 山西省动物疫病预防控制中心
• 出 处: 中国畜牧兽医
• 发表日期: 2004年期
• 关键词: 猪伪狂犬病病毒 TK基因 变异分析
• 基金项目: 山西省科技攻关项目(20110311034-3)

采用PCR方法对2011—2013年山西省分离的2株猪伪狂犬病病毒(pseudorabies virus,PRV)的胸苷激酶(TK)基因进行了克隆和测序,并将其基因序列和推导的氨基酸序列与国内外主要流行毒株Bartha株、Becker株、Ea株、Kaplan株、LA株、Min-A株、NIA-3株、SH株、SL株和Yangsan株进行了同源性分析。序列分析结果表明,核苷酸同源性分别为99.7%、99.6%、99.8%、99.7%、99.7%、94.4%、99.1%、57.2%、99.5%、99.7%;氨基酸同源性分别为99.1%、99.1%、99.7%、99.4%、99.4%、90.3%、98.1%、49.7%、98.8%、99.1%。另外在核苷酸序列中起始密码子上游有3段GC box的序列,终止密码子下游有多聚腺苷加尾信号AATAAA;TK基因均由320个氨基酸组成,氨基酸序列中有疱疹病毒TK基因共同的保守序列-R*Y*DG**G*GK*T-和-FDRHP*A***C*P*AR-。