肾透明细胞癌关键候选基因和通路的生物信息学分析

• 作 者: 肖菲 祝恒成
• 机 构: 武汉大学人民医院东院泌尿外科
• 出 处: 现代泌尿外科杂志
• 发表日期: 2020年12期
• 关键词: 肾透明细胞癌 生物信息学分析 差异表达基因 蛋白互作网络 核心基因 clear cell renal cell carcinomabioinformatical

目的运用生物信息学方法筛选及鉴定肾透明细胞癌(ccRCC)相关的潜在靶基因及信号通路。方法在GEO网站搜索基因芯片GSE40435、GSE53757、GSE46699和GSE16441的数据集,用GEO2R识别ccRCC和正常肾组织之间的差异表达基因,并对4组数据的共同差异表达基因进行聚类分析。然后用DAVID网站对差异基因进行基因本体(gene ontology)分析和KEGG通路富集分析,最后用STRING网站和Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,同时从中筛选出最具有意义的模块及核