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为解决存在平移变换和旋转变换的2幅刚性医学图像的配准问题，结合图像信号傅里叶变换的平移特性和旋转特性，提出了一种基于频域与时域相结合的医学图像配准算法。该算法将旋转调整和平移调整分而治之，首先以图像信号的幅度谱互相关确定旋转参数，再以图像的时域体素互相关确定平移参数。将该算法用于对核医学图像配准及多模态医学图像配准实验，结果表明该算法是一种速度快、精度高、鲁棒性好的医学图像配准方法。