目的 比较分析真菌毒素环境反应基因在大骨节病(Kashin-Beck disease,KBD)和正常关节软骨中的表达谱差异,探讨真菌毒素环境反应基因与KBD软骨损伤的关系.方法 采集9例KBD患者和9例正常对照关节软骨样本,提取总RNA.采用Agilent基因表达芯片评估真菌毒素环境反应基因在软骨样品中的表达量,并计算每个基因在KBD和正常对照软骨中表达量的比率(简称表达率).采用GSEA软件计算每个基因功能分类表达量的NES指数及P值.结果 ①T-2毒素、脱氧镰刀菌烯醇、玉米赤霉烯酮、黄曲霉毒素B1、伏马菌素B1和赫曲霉毒素A相关的15个环境反应基因在KBD和正常对照关节软骨中的表达水平存在差异(表达率>2.0或<0.5),其中13个基因在KBD软骨中上调,包括BAX、BCL2、COL5A2、FER1L3、GSTT2、IGFBP2、IGFBP4、PDE8B、SOCS3、THBS1、TMSL8、VGLL3和TUBB2A(表达率>2.0);2个基因在KBD软骨中下调,包括POSTN和FABP4(表达率<0.5).上述15个基因功能主要涉及胶原、细胞凋亡、代谢和生长发育等.②真菌毒素相关的4个凋亡基因功能分类和5个生长发育基因功能分类在KBD关节软骨中上调(NES>0),包括ANTI_APOPTOSIS、REGULATION OF PROGRAMMED_CELL_DEATH、APOPTOSIS_GO、EGULATION_OF_APOPTOSIS、ORGAN MORPHOGENES IS、ANATOMICAL_STRUCTURE_ DEVELOPMENT、ORGAN_DEVELOPMENT、SYSTEM DEVELOPMENT和REGULATION—OF_DEVELOPMENTAL_PROCESS (NES>0且P< 0.05).结论 KBD软骨中存在多种真菌毒素的环境反应基因表达且显著不同于正常对照,提示真菌毒素可能通过影响相关环境反应基因在关节软骨中的表达,诱发软骨细胞功能障碍和关节软骨损伤。
大骨节病关节软骨真菌毒素环境反应基因表达谱研究
【摘 要】
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目的 比较分析真菌毒素环境反应基因在大骨节病(Kashin-Beck disease,KBD)和正常关节软骨中的表达谱差异,探讨真菌毒素环境反应基因与KBD软骨损伤的关系.方法 采集9例KBD患者和9例正常对照关节软骨样本,提取总RNA.采用Agilent基因表达芯片评估真菌毒素环境反应基因在软骨样品中的表达量,并计算每个基因在KBD和正常对照软骨中表达量的比率(简称表达率).采用GSEA软件计算
【机 构】
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710061西安交通大学医学院环境与疾病相关基因教育部重点实验室及卫生部微量元素与地方病重点实验室,710061西安交通大学医学院第二附属医院骨科,710061西安交通大学医学院环境与疾病相关基因教育
【出 处】
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中华地方病学杂志
【发表日期】
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2012年31期
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