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创新系统的概念是在20世纪90年代形成的，与“自主创新”有着直接的渊源。全球化，信息技术革命和加剧的竞争态势，使得发达市场经济国家，尤其是欧洲国家，感到主张自由放任的主流经济学提不出足够有力的政策建议。在这样的背景下，来源于熊彼特学派的，集创新研究成果大成的创新系统理论很快被广泛接受。在研究工作方面，国际贸易、工业经济、经济地理和区域经济等领域与创新研究之间出现了明显的融合趋势。