【摘 要】
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该研究采用网络药理学虚拟筛选的方法,筛选牡丹抗流感病毒作用的潜在活性成分,预测抗流感病毒的作用靶点,探讨牡丹抗流感病毒活性的作用机制。首先,通过近10年中外文文献的查
【基金项目】
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国家重点研发计划项目(2017YFC170295);国家留学基金委项目(CSC201500850007);四川省科技厅科技支撑计划项目(2014SZ0131);四川省基础研究项目(2015JY0009);四川省阿坝州应用技术研究与开发项目(YYJS2017004);西南民族大学国家级大学生创业训练项目(201710656034);西南民族大学研究生创新科学研究项目(CX2017SZ097);西
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该研究采用网络药理学虚拟筛选的方法,筛选牡丹抗流感病毒作用的潜在活性成分,预测抗流感病毒的作用靶点,探讨牡丹抗流感病毒活性的作用机制。首先,通过近10年中外文文献的查询汇总了牡丹属301个小分子化合物,使用PubChem和Chemical Book等数据库进行结构确认,并借助Chem Draw,Avogadro和Discovery Studio Visualizer软件对其进行分子对接配体的构建。其次,结合STITCH靶标数据库和文献的查找拟定了23个潜在抗流感病毒的作用靶点,采用Uniprot数据库找到相对应的基因靶点,并通过RCSB网站寻找相对应的蛋白亚型的PDB ID以及阳性小分子结构为分子对接的受体,利用Quick Vina 2.0软件进行分子对接。最后,借助Cytoscape 3.5.1软件绘制牡丹抗流感病毒潜在活性成分与抗流感病毒作用靶点网络图,使用Uniprot在线数据库进行其靶点GO分析和KEGG代谢通路分析。结果显示,牡丹中有74个化合物具有良好抗流感病毒作用,筛选得到18个潜在的抗流感病毒作用靶点,通过GO分析推断牡丹抗流感病毒的作用机制与神经氨酸酶抗流感病毒机制基本一致,以阻止病毒的出芽、分散、扩散,使病毒的感染能力下降,使感染受限,从而达到抗流感病毒的作用。
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