犬源大肠埃希菌系统进化分群及相关毒力基因检测

• 作 者: 朱子琦 魏斌 但佳明 龙佳丽 蒋绍齐 黄晓山 刘海峰 周紫峣
• 机 构: 四川农业大学动物医学院/动物疫病与人类健康四川省重点实验室,山西省清徐县动物疾病预防控制中心,中国人民解放军总医院第三医学中心检验科,南京农业大学动物医学院
• 出 处: 江西农业大学学报
• 发表日期: 2020年3期
• 关键词: 大肠埃希菌 系统进化分群 毒力基因 犬源 Escherichia coliphylogenetic clusteringvirulence genecanine
• 基金项目: 国家重点研发计划项目(2018YFD0500900,2016YFD0501009),成都大熊猫繁育研究基金会项目(CPF2017-05,CPF2015-4),四川农业大学本科生科研兴趣培养项目(2019217,2019218)

【目的】探究腹泻犬源大肠埃希菌系统进化分群以及17种毒力因子的分布情况。【方法】采用PCR对成都地区分离的30株腹泻犬源大肠埃希菌进行菌株系统进化分群鉴定,同时对17种毒力基因进行检测。【结果】系统进化分群结果显示,30株分离株中A群系占53.33%(16/30),B1群系占23.33%(7/30),D群系占23.33%(7/30),未检出B2群系。17种毒力基因中fimC检出率最高(96.67%,29/30);其次为sitA(66.67%,20/30)、ompT(46.67%,14/30)、iss(16