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《方案》明确，“到２０２０年初步形成布局合理、定位清晰、管理科学、开放共享、多元投入、动态调整的国家科技创新基地建设发展体系”。为实现该目标，《方案》提出坚持顶层设计、机制创新、分类管理、能力提升等四大基本原则，坚持优化国家科技创新基地布局与优化调整现有国家级基地并重，辅以完善运行管理机制、完善评估考核机制、完善资源配置机制等三大管理运行机制，并明确了今明两年的实施进度和工作要求。