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行政权力与学术权力的严重失衡已经成为制约我国现代大学制度建立的重要障碍。加强大学学术组织建设是提升学术权力的有效途径。针对当前进行的校院管理体制改革,提出了科学设置适应校院两级管理的基层学术组织,合理构建跨学科矩阵化的学术组织运行体系,建立健全规范的学术管理制度等建议以加强大学学术组织的创新。