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以银杏小孢子叶球为材料，比较了不同的提取的方法、蛋白质裂解液组成、pH值范围以及不同质量浓度SDS—PAGE凝胶对双向电泳的影响。结果表明：TCA／丙酮／酚法比TCA／丙酮法更适合于银杏小孢子叶球蛋白的提取；含有硫脲的蛋白质裂解液Ⅱ，可显著提高蛋白质的溶解性，在2-DE图谱上可分辨出748个蛋白质点，比用蛋白质裂解液Ⅰ提取的蛋白点数多620个。采用pH3—10的胶条分离时，蛋白点集中在pH=4～8,使用pH=4—7的胶条，图谱胶点重叠少，也较清晰，更利于低丰度蛋白的检出。用TCA／丙酮／酚提取蛋白，并以蛋