【摘 要】
：
目的 通过网络药理学预测清幽养胃胶囊治疗Hp感染慢性萎缩性胃炎有效成分、作用靶点及相关信号通路并通过分子对接技术验证.方法 利用TCMSP数据库、SwissTargetPrediction、STITCH数据库获得药物的有效成分以及靶点.通过GeneCards、OMIM数据库获得疾病靶点.用String数据库构建PPI网络,用软件Cytoscape 3.7.2构建活性成分-靶点-药物-疾病网络关系,用R语言进行生物功能和通路分析.运用PDB数据库、PubChem数据库、AutoDuck软件等工具进行关键靶蛋
【机 构】
：
南京中医药大学中医学院·中西医结合学院 南京 210023;南京中医药大学中医学院·中西医结合学院 南京 210023;辽宁中医药大学中医药创新工程技术中心沈阳 110847;南京中医药大学附属医院消
论文部分内容阅读
目的 通过网络药理学预测清幽养胃胶囊治疗Hp感染慢性萎缩性胃炎有效成分、作用靶点及相关信号通路并通过分子对接技术验证.方法 利用TCMSP数据库、SwissTargetPrediction、STITCH数据库获得药物的有效成分以及靶点.通过GeneCards、OMIM数据库获得疾病靶点.用String数据库构建PPI网络,用软件Cytoscape 3.7.2构建活性成分-靶点-药物-疾病网络关系,用R语言进行生物功能和通路分析.运用PDB数据库、PubChem数据库、AutoDuck软件等工具进行关键靶蛋白与相关化合物的分子对接,以验证其治疗作用.结果 预测得到清幽养胃胶囊治疗Hp感染慢性萎缩性胃炎的206个成分,涉及119个靶点,跟PI3K/Akt、IL-17、TLR等信号通路有关,并发现AKT1、IL6、ALB、CASP3、VEGFA等关键靶点.分子对接表明关键靶蛋白与相关活性成分结合程度较好,且绝大多数优于阳性对照药.结论 清幽养胃胶囊通过多成分、多靶点的形式治疗Hp感染慢性萎缩性胃炎,为进一步探究其机制打好基础.
其他文献
目的 发现四物汤的新药理作用并辨识其有效成分群.方法 于GEO和Cmap数据库获取四物汤和1309个小分子药物的基因表达谱,计算差异表达基因及四物汤与1309个小分子药物的基因表达谱间的相似性,相似性较高的小分子药物的药理作用为四物汤的新药理作用.相似性较高的小分子药物的靶点作为四物汤发挥新药理作用的靶标,利用分子对接技术辨识四物汤的有效成分群.结果 四物汤具有抗乳腺癌的作用,其有效成分群为荭草苷、芍药苷和半乳糖醛酸等,并通过文献调研验证了辨识结果的可靠性.结论 本研究将为扩大四物汤的临床应用范围及质量控
西红花为鸢尾科番红花属植物番红花的干燥柱头,是中医临床常用的活血化瘀药,主产于伊朗、印度、希腊和摩洛哥等国家.现代药理研究表明,西红花不仅具有抗惊厥、抗抑郁、抗炎和抗氧化等药理活性,近年来其抗肿瘤活性也逐渐受到了国内外学者的关注.西红花中具有抗肿瘤作用的活性成分主要为西红花苷、西红花酸、西红花醛和西红花苦素,对乳腺癌、肺癌、肝癌、白血病、皮肤癌等多种恶性肿瘤均具有抑制作用,其作用机理包括:诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞,增加化疗药敏感度及抑制肿瘤转移等.本文将从西红花的资源分布、抗肿瘤活性成分及作用机制方面进
目的 本研究旨在观察山慈菇提取物对人结直肠癌SW480细胞迁移和侵袭能力的影响,并探讨其分子机制.方法 取人结直肠癌SW480细胞作为研究对象,采用划痕实验和Transwell法检测细胞迁移和侵袭能力,采用短发夹RNA(Short hairpin RNA,shRNA)干扰技术沉默SW480细胞中星形细胞上调基因-1(astrocyte elevated gene-1,AEG-1)基因的表达,利用Western blot法检测基质金属蛋白酶-2,9(matrix metalloproteinase-2,9,
目的 采用Box-Behnken法优化关白附粗多糖经DEAE-Sepharose Fast Flow离子交换色谱法分离得到0.2M NaCl部位多糖ACP02的纯化工艺,为该成分的富集和后续的药效开发打下基础.方法 在单因素试验基础上,以上样量、洗脱时间、洗脱流速为影响因素,总多糖含量为评价指标,Box-Behnken响应面法优化纯化工艺.以雄性BALB/C裸鼠注射HT-29单细胞悬液作为结肠癌肝转移模型,分别用多糖低剂量组(100 mg·kg-1)、多糖高剂量组(200 mg·kg-1)处理,观察老鼠体
中药黄芩具有抗炎、抗菌、抗肿瘤、抗氧化等多种药理作用,临床上已有许多含有黄芩的中药制剂应用于口腔溃疡、牙周炎等口腔疾病.黄芩苷、黄芩素、汉黄芩素等黄酮类成分被认为是黄芩发挥药效的主要活性成分.本文系统综述近十几年黄芩在口腔疾病方面的应用,并整理归纳了黄芩主要活性化学说成分在口腔疾病中的作用靶点和机制,为将来黄芩在口腔疾病方面的研究方向提供理论参考.
川芎为我国常用传统中药材,临床应用广泛.随着对川芎研究的不断深入,其有效成分及新产品研发得到广泛关注,具有良好应用开发前景.本文在对其资源分布、化学成分和药理作用进行了总结和综述,根据质量标志物(Q-marker)理念,通过化学成分与成分有效性、成分可测性、入血成分、不同配伍中表达成分、贮藏温度几个方面对川芎质量标志物成分进行预测与分析,为完善川芎质量评价标准提供科学基础和依据.
目的 运用网络药理学方法探索地稔治疗宫颈癌的潜在作用机制.方法 通过检索相关文献得到地稔化学成分并筛选出地稔的活性成分,利用SwissTargetPrediction平台预测活性成分的潜在靶点.利用Genecards数据库检索宫颈癌相关靶点.利用Cytoscape3.7.2软件构建“地稔-活性成分-宫颈癌靶点”网络,并运用String数据库构建蛋白互作网络(protein-protein interaction,PPI).使用OmicShare Tools数据库进行基因本体(Gene Ontology,G
目的 验证基于快速区域卷积神经网络萎缩性胃炎-胃癌胃镜图像自动识别系统,并探讨其临床应用价值.方法 回顾性收集80例萎缩性胃炎-胃癌患者的640张胃镜图像序列,将所有图像序列作为训练组输入卷积神经网络系统,建立图像自动识别模型,通过读取图像进行验证,记录识别准确率,绘制精确回归曲线.结果 模型训练损失在12轮训练后基本趋于0,准确率在第29轮达到最大值98％,在42轮以后也基本稳定在最大值.结论 卷积神经网络系统能够帮助消化科医师对萎缩性胃炎-胃癌进行诊断,具有一定的临床应用价值.
目的 应用数据挖掘和网络药理学方法探索治疗骨质疏松症的专利中药复方的用药规律和潜在机制,为临床诊治及新药研发提供参考.方法 以国家知识产权局的授权专利为资料来源,筛选治疗骨质疏松症的中药复方,使用整合药理学平台(TCMIP V2.0)分析筛选复方的中药频次统计、对药角药分析、性味归经分析等;用IBM SPSS Modeler 18.0软件对所录中药进行关联规则分析并制图;基于TCMIP V2.0平台对药物-疾病关联网络进行深入挖掘.结果 纳入中药复方专利数据299条,共涉及中药670味;挖掘核心药物为:熟
目的 通过网络药理学方法探讨并验证丹葛五苓散治疗CHF的作用机制,并通过C57雄性小鼠慢性心力衰竭模型对相关靶点蛋白进行验证.方法 ①本研究基于中药系统药理学技术平台、蛋白数据库和String数据库,分别获取丹葛五苓散中化学成分及其对应靶点、疾病并构建化合物-靶点,靶点-疾病网络,蛋白相互作用网络,通过生物学信息注释数据库(DAVID)注释数据库对靶点进行基因本体生物学过程(gene ontology(GO-BP、CC、MF))富集分析及基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Gene