新城疫病毒F48E9株F基因主要功能区的核苷酸序列分析

• 作 者: 苑纯秀 曹殿军 郭鑫 闵平 卢景良
• 机 构: 中国农科院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
• 出 处: 中国预防兽医学报
• 发表日期: 2004年期
• 关键词: 新城疫病毒 F基因 克隆 序列分析
• 基金项目: 国家85攀登计划B项目

本试验首先以ＮＤＶＦ４８Ｅ９株的基因组ＲＮＡ为模板，逆转录合成Ｆ基因ｃＤＮＡ第一链，再通过ＰＣＲ技术扩增Ｆ基因的ｃＤＮＡ，然后将其克隆到质粒ｐＵＣ１９中，经分子量比较、酶切分析、ＰＣＲ等方法证明，我们已经获得了ＮＤＶＦ４８Ｅ９株Ｆ基因的阳性克隆。经初步序列分析，ＦＡ段核苷酸序列与参考株（Ｄ２６／７６）序列同源性为８９％，ＦＢ段同源性为９１％。二者的氨基酸序列表明，Ｆ４８Ｅ９株Ｆ蛋白裂解位点与其它强毒株裂解位点氨基酸组成相同，即１１２ＲＲＱＲＲ１１６Ｆ１１７。这两段序列中包含的三个Ｃｙｓ残基和三个潜在的糖基化位点都相当保守。