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消化道微生物在宿主生长、营养和健康等方面起到重要的作用。本实验采用基于PCR扩增的变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）技术比较研究了主养草鱼（Ctenopharyngodon idellus）池塘三种不同混养模式下的鱼类肠道菌群差异。结果表明,三种混养模式下同种鱼的生长率出现显著性差异（P〈0.05）,而肠道细菌16SrDNA V3区特征片段PCR-DGGE指纹分析显示草鱼的肠道菌群相似性较高（〉42.2%）;投喂配合饲料的草鱼与摄食浮游生物的鲢（Hypophthalmichthys molitrix）、