【摘 要】
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对于除了标准氨基酸、核酸残基以外的一般分子,派定分子中原子的原子类型,确定原子类型在不同分子势场之间的转换,这些工作一般是由人工来完成。本文从分子拓扑学的角度解析
【机 构】
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北京理工大学机电工程学院,北京理工大学机电工程学院 北京 100081,北京 100081
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对于除了标准氨基酸、核酸残基以外的一般分子,派定分子中原子的原子类型,确定原子类型在不同分子势场之间的转换,这些工作一般是由人工来完成。本文从分子拓扑学的角度解析了分子势场的原子类型(atom type)定义,以基于分子拓扑子集取代原子类型定义的分子片断为途径,实现势场原子类型的计算机自动派定。该方法易于编程,并能满足用户调整原子类型的意愿。
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