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铜绿假单胞菌是世界范围内医院获得性感染的重要病原菌。对引起疾病的病原菌基因分型的传染源确定、阻止病原菌的传播、潜在病原菌危险的控制和医院耐药监测有很重要的作用。细菌分型作为分子流行病学研究调查的主要研究内容，其结果的准确性依赖于分型方法是否稳定可靠、准确［1］。细菌分型的方法包括依靠生理、生化特征的表型分型法和近年来流行使用的基因分型法。表型分型方法是根据细菌的生理、生化等表型特征进行分类包括噬菌体分型法、血清型法、营养分型法和药物敏感试验等，这些分型的方法由于受到细菌本身复杂因素及方法的敏感性因素影响，往往就无法有效对不同的菌株进行区分，因此其应用受到很大限制。运用分子生物学方法检测细菌基因型来鉴别菌株的基因分型法，是1980年起逐渐被引入微生物鉴定领域，成为目前较主流的流行病学研究工具，在基因组水平对细菌进行鉴定与分类，与表型分型相比更加细化，对院内引起感染的铜绿假单胞菌近亲缘性，即克隆性菌株鉴定有重要意义，从根本上确定菌株遗传基础的相互联系和变异，为流行病调查工作中确定菌株间的遗传亲缘关系等方面提供更为有力的实验室证据［2］。基因分型法目前运用较多的有：重复序列聚合酶链反应（PCR ）、随机扩增多态性 DNA （RAPD）、多位点可变数目串联重复序列分析（VNTR）、限制性片段长度多态性PCR（RFLP）、多位点序列分型（MLST ）、脉冲场凝胶电泳（PFGE）。分型方法是在微生物学、遗传学、流行病学等交叉学科一系列研究中的工具，选择合适的方法，有效监测院内病原菌的分子流行病学变化，如此研究预期和最终目的才能达到。现就目前常用于铜绿假单胞菌基因分型的技术进行简要介绍。