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目的探索用ISSR分子标记方法在核酸分子水平上鉴别道地药材化橘红。方法从20条ISSR引物中筛选合适的引物对化橘红、橘子、柚子等共16个样品进行PCR扩增及电泳分析,寻找特征位点。结果有2条ISSR引物扩增出较为明显的多态性特征条带,可单独或联合应用鉴别化橘红。结论ISSR作为一种简便、可靠的分子标记方法,可用于化橘红的鉴别。