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包囊游仆虫休眠包囊中，各类纤毛器的纤毛基体上方的大部分纤毛杆退化，或仅保留毛基体，有时部分额腹棘毛的毛基体也瓦解消失。残留纤毛的纤毛杆周围微管和中央微管仍具有“９＋２”结构特征，也有少数纤毛杆出现２套“９＋２”微管共处于一层纤毛膜内的现象。毛基体中周围三联体微管的中央形成微管形结构聚合体，基体附属结构仅存在基体间连接及纤毛器托架的残余物；非纤毛区皮层表膜下未见微管层。纤毛区皮层含纤毛器腔周围微管层