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本文提出了一种比较DNA序列的方法,对于通过数学方法提取出的含有DNA序列信息的多种数值特征构成的向量,设计了一种新的聚类算法,使其能对一组向量进行有效分类从而达到对DNA序列进行比较的目的.为了避免传统算法的缺陷和增加达到分类最优解的概率,我们将遗传算法引入进来,提出了一种基于遗传算法的聚类算法.一组对八种有胎盘哺乳动物的线粒体全基因组序列的分类实验验证了该方法的有效性.