高通量测序一株天鹅源H5N8亚型流感病毒遗传演化分析

• 作 者: 赵璐 刘建文 李月辉 昝亚楠 李玉磊 刘丽娜 刘丽玲 田国彬
• 机 构: 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/农业部动物流感重点开放实验室,天津市动物疫病预防控制中心
• 出 处: 中国预防兽医学报
• 发表日期: 2018年9期
• 关键词: 禽流感病毒 H5N8亚型 高通量测序 进化分析 avian influenza virusH5N8 subtypehigh-throughput sequenc
• 基金项目: 国家自然科学基金创新群体项目（31521005）, 动物流感病毒的进化及其与宿主互作机制中的子课题-动物流感病毒的生物学特性, 农业部动物流感监测与防治专项

为研究一株天鹅源H5N8亚型禽流感病毒（AIV）的遗传演化规律,本研究对2016年从山西省疾控中心送检天鹅样品中分离到的一株H5N8亚型流感病毒（A/swan/Shanxi/6/2016）的全基因组序列进行高通量测序及遗传演化分析。结果显示,分离的病毒为Clade2.3.4.4分支高致病禽流感病毒（HPAIV）; BLAST分析显示该分离株的NP基因与H3N8亚型AIV的NP基因具有较高同源性,而其它基因节段则分别与来自其它国家的H5N8亚型AIV的相应基因节段同源性较高,进一步选取与各基因节段核苷酸同源