【摘 要】
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随着生物信息学的发展,人们需要实现微生物环形染色体三维折叠结构的可视化,以此来减少大量的工作量,而目前国内外关于微生物环形染色体的可视化研究处理却少之甚少.基于此,
【机 构】
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吉林大学计算机科学与技术学院 吉林 长春 130012
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随着生物信息学的发展,人们需要实现微生物环形染色体三维折叠结构的可视化,以此来减少大量的工作量,而目前国内外关于微生物环形染色体的可视化研究处理却少之甚少.基于此,本文结合Supercoil算法对如何实现微生物环形染色体三维折叠的可视化进行分析探讨.用户可以上传基因片段信息、生理生长环境和生物路径数据文件以及操纵子文件,通过Supercoil算法获得基因详细情况、基因片段离散信息和共同表达基因对详情的输出文件,这些输出文件再通过R语言中Circlize包的处理输出微生物环形染色体的三维折叠图.
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