【摘 要】
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为研究残基和水之间的信号传递对蛋白质热稳定性的影响,以野生型脂肪酶(WTL)及其突变体(6B)在不同温度下的分子动力学模拟轨迹为基础,构建了以残基和水为节点,残基-残基及残
【机 构】
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江南大学理学院,江苏省媒体设计与软件技术重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金项目(21541006)。
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为研究残基和水之间的信号传递对蛋白质热稳定性的影响,以野生型脂肪酶(WTL)及其突变体(6B)在不同温度下的分子动力学模拟轨迹为基础,构建了以残基和水为节点,残基-残基及残基-水的相互作用为边的残基-残基和残基-水相互作用网络。通过Dijkstra算法计算网络中节点之间的最短路径,结果表明,300 K时,WTL和6B的αB与β4之间的loop和αB上的残基频繁与水通讯,降低了该区域的柔性。400 K时,WTL仅仅加强了αC内部的连接,而6B中β7与β8之间的loop、αA以及最长的loop之间相互连接并且
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