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支持自主创新企业的快速发展已经成为我国创新型国家建设的发展战略,最新通过的＂十二五＂规划建议再次强调了科技进步与创新在我国经济结构战略性调整方面发挥的推动力,作为支持国家经济发展的资本市场,在促进自主创新企业发展中具有重要作用。本文主要从我国资本市场与自主创新企业之间的关系研究入手,分析资本市场与自主创新企业的发展现状及趋势,然后选取相关变量对两者的相关关系进行实证分析。实证结果表明,我国资本市场尤其是股票市场对自主创新企业发展具有重要影响,资本市场的健康稳定发展和多层次市场体系建设显得尤为重要。