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栖息在肠道的微生物群构成了人体肠道复杂的微生态体系。新生儿出生时就有肠道微生物群的即刻定植，其定植过程受分娩方式、喂养方式和所接触周围环境的影响。大量研究表明肠道微生态学的变化通过对肠黏膜免疫功能的影响而致肠内或肠外疾病。肠道正常菌群具有抵抗致病菌侵入、营养支持和调节宿主脂肪代谢等作用，在维持肠道微生态平衡、保护胃肠道健康方面发挥重要作用。益生菌通过促进和调节肠道微生态平衡维护机体健康。现就肠道微生态学变化与儿童期胃肠疾病的关系进行综述。