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创新是管理的基本内容和本质职能，科研管理创新是科研院所生存、维持与发展壮大的源动力。根据我国省级水产研究所科研管理的区域性、公益性和开放性特征，以及针对当前省级水产研究所科研管理的现状与普遍存在的问题。科研管理创新首先要正确认识管理创新与科研管理的关系；科研管理创新必须坚持贯穿以人为本的管理理念；科研管理决策必须从实际情况出发，提高前瞻性创新意识；科研管理创新必须以制度的创新为保障。