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本文主要阐述了分子标记在林木辅助选择育种中的应用。利用多种分子标记（ＲＡＰＤ，ＲＦＬＰ，ＡＦＬＰ，ＳＴＳ，ＳＳＲ，ＳＴＲ等），可以在林木早期上生长阶段对一些性状进行鉴别，构建单种分子标记遗传连锁图谱或几种分子标记共存的混合连锁图谱和对控制数量性状的基因进行定位，对林木群体遗传结构、遗传变异、遗传分化和基因流动进行研究，在基因工程中，能够追踪目标的基因行为和地控制质量性状的进行鉴别，对单进行指纹图谱