【摘 要】
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为了理解非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）与HIV-1逆转录酶（RT）的相互作用机制,利用新力场ff12SB对未结合和结合Efavirenz（EFV）逆转录酶的三种RT大分子体系分别进行了100 ns的长时间
【基金项目】
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国家自然科学基金(11274206)资助项目~~
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为了理解非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）与HIV-1逆转录酶（RT）的相互作用机制,利用新力场ff12SB对未结合和结合Efavirenz（EFV）逆转录酶的三种RT大分子体系分别进行了100 ns的长时间动力学模拟。通过分析EFV对RT结构的影响、不同残基柔性和不同体系构象的动力学行为等,发现EFV的结合会导致RT结构变化,从而影响RT的活性;证实了EFV的＂分子楔＂作用;还发现EFV的结合不但引起＂拇指关节炎＂,而且引起轻度＂手指关节炎＂;整个模拟过程中没有出现不同构象间的跃迁,但是无别构分子时
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