基于高通量测序的大豆根际真菌群落动态变化分析

来源 :分子植物育种 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Northbay
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为了明确大豆生长过程中根际土壤真菌群落组成及其影响因素,选取黑龙江省农业科学院生态试验田中栽培品种‘绥农36号’(ZP)和野生品种(Y1)2种大豆,采用Illumina MiSeq高通量测序技术分别对种植前期(Pp)、分枝期(Bp)、开花结荚期(Fp)和成熟期(Mp)的根际土壤进行ITS rDNA测定,同时,对以上各时期的土壤理化性质以及真菌群落结构的相关性进行分析.结果表明:从生长期到收获期,真菌多样性和丰富度整体表现为逐渐增多,在收获期时达到较高.测序结果表明,担子菌门(Basidiomycota)和子囊菌门(Ascomy-cota)是大豆根际真菌群落的优势菌门,在不同时期所占比例约50%;未鉴定分类(f_unidentified_Unclassified)和未分类(Unclassi-fied)的2种菌属为大豆根际的优势菌属,随生长期变化,优势菌门和优势菌属含量出现一定差异.结合其他优势菌群在不同生长时期的变化,表明大豆生长时期的改变影响着其根际真菌群落的动态变化;同时总氮(TN)和有机质(OM)对真菌群落的分布影响较大.研究结果为大豆生长过程中土壤质量、营养状况以及微生态效应的评估提供数据参考和理论依据.
其他文献
珊瑚菜(Glehnia littoralis)又名北沙参,是一种常用药食同源植物.现珊瑚菜野生种群十分稀缺,是国家二级保护植物之一.本研究通过MISA软件对珊瑚菜转录组78 828条Unigenes中简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)位点信息进行挖掘与分析,共鉴定出14 421个SSR位点,SSR发生频率为15.43%.珊瑚菜转录组SSR位点的种类从单碱基到六碱基重复均有分布,主要重复类型是单核苷酸和双核苷酸,分别占SSR总数的39.98%和40.98%.SSR位点的最
国家Ⅱ级保护植物——青梅,作为热带雨林优势种,具有重要的生态作用,为了解其种质资源分布与种群动态情况.本研究对全岛18个市县25个分布点的青梅种质资源进行了实地调查,分析海南岛青梅种质资源现状、群落生境、种群年龄结构和种群动态.研究结果表明,海南岛青梅资源以天然居群分布为主,主要分布于海南岛的中南部山区和东北部沿海地区,大部分种群的数量仍在1 000株以下;万宁青梅保护区为全岛面积最大的青梅纯林,其次是乐东佳西自然保护区.RYW种群有较多的幼龄个体,属于增长型种群,DLS种群和HML种群的Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ龄级的
为了解16份小麦种质材料的苗期抗旱性和耐盐性,本研究分别以20%PEG-6000溶液和0.20 mol/L NaCl溶液模拟干旱胁迫和盐胁迫,对其抗氧化酶活性、叶绿素含量、细胞质膜透性、苗长、根系性状、生物量等指标进行测定,应用隶属函数、因子分析和聚类分析等方法综合评价小麦苗期抗旱性和耐盐性.结果表明,在胁迫处理下,小麦的苗长、总根长、总根面积、总根体积、根鲜重、苗鲜重、根干重、苗干重和叶绿素含量均低于对照;细胞质膜透性的损伤程度均大于对照,但盐胁迫下损伤更为严重;抗氧化酶(SOD,POD,CAT)活性升
茄子受低温胁迫后植株生长和果实品质受到严重影响.为了筛选茄子耐低温种质并从分子水平上揭示其与耐低温的相关性.本研究在前期预试验的基础上筛选出2份不同基因型的茄子自交系材料,研究了低温胁迫对其种子萌发和幼苗伤害的影响.并以幼苗在4℃低温处理下的叶片为材料进行转录组测序,对差异表达基因进行功能分类和富集分析.结果发现,‘CHEN18’在种子萌发和幼苗低温耐受性上远强于‘819’.转录组数据分析表明两个茄子材料在遗传背景上存在一定的差异,低温处理使得二者在生物调节过程、细胞过程、代谢过程和单有机体过程中存在着较
洋桔梗是全球最重要的鲜切花之一,但洋桔梗切花质地柔软,在销售和消费环节如保鲜处理措施不当,易导致品质下降,出现花、叶干萎,瓶插寿命缩短等现象.为了探寻洋桔梗切花安全的保鲜剂及配方,本研究通过探索不同外源褪黑素浓度梯度下洋桔梗切花外观形态及各项生理指标的变化,旨在筛选出最佳的褪黑素浓度.试验以洋桔梗切花为材料,选用蔗糖、8-羟基喹啉和柠檬酸为瓶插液的基本成分,添加不同浓度褪黑素进行对比研究.结果表明,适宜浓度的褪黑素能显著提升洋桔梗切花的瓶插寿命及其观赏价值,维持较为稳定的水分平衡值.随着瓶插时间的延长,C
为探究矮壮素对永福报春苣苔(Primulina yungfuensis)营养生长、开花的影响,筛选控制株型的最佳处理.本研究以永福报春苣苔两年生扦插苗为材料,使用6种不同质量浓度的矮壮素,以清水为对照对植株进行灌根和叶喷.结果表明,在叶面喷施和根灌处理2种施用方式下,各处理浓度均具有矮化控制效果且随浓度的增加呈现先增加后减弱的变化趋势,其中以矮壮素400~500 mg/L为最佳施用浓度范围.从处理方式看,叶面喷施和根灌对植株的冠幅、叶长、叶宽、叶柄长均有影响,但差异不明显;对于初花期的影响表现为低浓度(约
香稻育种已成为当前杂交水稻育种的一个重要方向,选择和利用株型好、米质优、抗性强等综合性状优良且具有香味的水稻亲本,尤其是香型水稻恢复系亲本的利用,对进一步促进杂交水稻香稻的选育具有重要意义.\'泰国小香占\'是目前国内水稻香稻育种中应用较广且综合性状优良的恢复系亲本,其米质优、抗性强、香味浓.为了探究\'泰国小香占\'香味产生的原因,本研究鉴定了\'泰国小香占\'的香味基因及其突变类型,发现其香味来源于编码甜菜碱脱氢酶基因Badh2的功能缺失突变,且通过对该基因完整基因组序列扩增和
为了明确民族传统中药材红花龙胆(Gentiana rhodantha Franch.ex Hemsl)内生真菌群落结构及功能,本研究采用组织块分离法,对贵州省六盘水地区的野生红花龙胆内生菌进行分析,结合形态特征和ITS序列对分离的菌株进行鉴定,并阐述内生菌多样性;采用平板对峙法筛选能显著抑制红花龙胆菌核病菌(Scle-rotinia sclerotionrum)生长的内生菌株.结果表明:从六盘水地区钟山凤凰、水城南开、水城杨梅和六枝新场等4个点的480个野生红花龙胆组织块中分离获得294株内生真菌,隶属3
扭果花旗杆(Dontostemon elegans Maxim)是新疆达坂城荒漠地区广泛分布的旱生植物,具有极强的抗旱性,在维持荒漠植被的稳定性中发挥重大作用。本研究采用不同浓度梯度的PEG-6000溶液模拟干旱胁迫处理扭果花旗杆幼苗,并测定其生理指标及细胞学特征,分析干旱胁迫对扭果花旗杆幼苗生理特性及根尖细胞染色体行为的影响。结果表明:(1)低浓度PEG (≤20%)处理扭果花旗杆幼苗,其超氧化
全世界盐渍化土壤越来越多,而适宜在盐渍化土壤上种植的作物却很少.高粱耐盐性极强常被作为作物耐盐性研究的理想模式作物之一.筛选种子萌发期耐盐、盐敏感材料以及挖掘耐盐相关基因对高粱耐盐育种以及探究高粱耐盐分子机制都具有重要意义.利用全球不同地区收集的不同类型高粱材料636份,在水培养条件下进行种子萌发,统计出苗率.出苗率≥90%的材料利用1.2%NaCl模拟盐胁迫筛选耐盐和盐敏感材料.选择抽穗期、株高和用途相近的极度耐盐和盐敏感材料用于基因定位群体的构建.636份高粱材料在28℃水培养条件下,出苗率达到一级、