大白猪及巴马香猪GHRH基因的SNPs筛选及其与体尺的相关性分析

来源 :吉林农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zabdtt
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为了解影响猪生长和体尺的重要候选基因(GHRH基因)多态性与猪体尺的相关性,选取大白猪为大型猪的代表,巴马香猪为小型猪的代表,利用测序法筛查了两猪种间GHRH基因上存在的SNPs,统计了各个SNP在2个猪种的基因型频率及等位基因频率,然后基于基因型频率对每个SNP与猪体型的相关性进行分析,并将筛选到的与猪体型相关的SNPs进行连锁不平衡及单倍型分析.结果表明:共有7个SNPs存在于两猪种间,分别为g.1874A>C、g.2276A>G、g.4165 C>-、g.4238T>C、g.8079 I>-(GTGCTGGCGTGAG缺失)、g.8114 A>G及g.8178A>G,且这些SNPs均与猪体尺性状显著相关,其中g.2276A>G和g.4165 C>-存在连锁效应,并且大白猪形成的优势单倍型为AC,而巴马香猪为G-型,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P-、g.8114 A>G及g.8178A>G)在大白猪中形成的单倍型为-GA,而巴马香猪为IAG,单倍型频率在两猪种间存在极显著差异(P<0.001).这说明猪GHRH基因上存在的SNPs与猪体尺相关,可作为猪种遗传性状及育种的筛选标记,将为提高养猪经济效益及猪育种提供理论依据.
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