【摘 要】
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目的 对2株犬源狂犬病病毒街毒株全基因组测序,了解国内狂犬病病毒的流行和变异情况.方法 采用乳鼠脑内接种方法分离2株天津地区狂犬病病毒街毒株,RT-PCR扩增病毒DNA覆盖全基
【机 构】
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吉林大学农学部畜牧兽医学院，吉林长春130062;军事医学科学院军事兽医研究所，吉林长春130122;军事医学科学院军事兽医研究所,吉林长春,130122;中国医学科学院医学实验动物研究所，北京100
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目的 对2株犬源狂犬病病毒街毒株全基因组测序,了解国内狂犬病病毒的流行和变异情况.方法 采用乳鼠脑内接种方法分离2株天津地区狂犬病病毒街毒株,RT-PCR扩增病毒DNA覆盖全基因组12个相互重叠的基因片段,PCR产物平端克隆后进行全基因组核苷酸序列测定,然后对其分子变异和进化特点进行分析.进行两分离株的序列相似性、氨基酸同源性、主要功能位点的变异比较和种系发生分析.结果 TJD04和TJD05两株狂犬病病毒全基因组长均为11 924 nts,全基因组序列的组成和结构均符合弹状病毒科狂犬病病毒属的特征.病毒基因组由5个编码区组成,基因起始位点和终止位点高度保守,氨基酸编码长度未发生变异,5个编码蛋白序列较少发生变化,仅有个别主要功能位点发生变异,且大部分变异均属于无意义沉默突变.多序列相似性比较和种系发生分析显示,两株病毒均属于基因1型,N基因与全基因进化树保持一致,与中国犬源狂犬病病毒BD06同源性最高(99.6％),进化关系近,并具有较为独特的中国地域特点.结论 两天津株狂犬病毒可能是自然界中固有的狂犬病病毒街毒株.
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