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遗传育种研究中心始于1958年建所时成立的栽培育种研究室。历经四十多年的发展，已经建成包括烟草种质资源、生物技术、遗传育种．种子加工、品种推广等研究内容的烟草遗传育种优势学科，并形成了以遗传育种为主体、栽培、营养、调制、病虫害鉴定．质量检测、情报信息为支撑的遗传育种创新体系，同时承担中国烟草青州原种繁殖基地和中烟种子有限责任公司青岛分公司的工作任务。在中心的基础上，2004年经国家发展与改革委员会批准，成立国家烟草改良中心。