小鼠后肢特异表达基因的筛选及验证

来源 :中国实验动物学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：cooltcp

【摘要】

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目的对比小鼠前后肢基因表达谱的变化,筛选小鼠后肢特异表达的基因。方法通过NCBIGEO数据库查找小鼠前后肢基因表达芯片,使用Transcriptome Analysis Console软件对原始数据(

【作者】

：

王茂春段维旺李凯周宇荀肖君华

【机构】

：

东华大学生物研究所

【出处】

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中国实验动物学报

【发表日期】

：

2019年1期

【关键词】

：

基因芯片肢体发育后肢特异表达小鼠 gene chip limb development hind limb-specific expression mou

【基金项目】

：

国家自然基金面上项目(31772550),上海市科委关键项目(16140901300,16140901302).

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目的对比小鼠前后肢基因表达谱的变化,筛选小鼠后肢特异表达的基因。方法通过NCBIGEO数据库查找小鼠前后肢基因表达芯片,使用Transcriptome Analysis Console软件对原始数据(5个前肢E10.5d芯片及4个后肢E10.5d芯片)进行质控,利用差异倍数为2倍以上或0.5倍以下及P值小于0.05进行数据过滤,绘制差异表达基因的火山图,并进行聚类分析,构建后肢特异表达基因的相互作用分子网络图。结果小鼠胚胎E10.5d后肢相较于前肢的差异表达的基因共有275个,其中上调的基因45个,下调的

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