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利用透射电镜对柔嫩艾美耳球虫裂殖子的超微结构进行了观察描述。柔嫩艾美耳球虫殖子的表膜由外膜和内膜复合体两层组成，外膜连续，内膜复合体在头部断开形成极环，在其它部位断开形成微孔；裂殖子的膜下微管２４根，超始于极环，向后延伸至细胞核处；裂植子的头部由顶泡、锥体和极环组成，锥体和顶泡可以伸缩；柔嫩艾美耳球虫裂殖子棒状体３个以上，微线数量很多，二者都由电子致密的结构组成；细胞核位于裂殖子的中后部，外被双层膜吸电子致密的核仁和染色质。