禽腺病毒1型和4型六邻体蛋白抗原表位和密码子偏爱性分析

• 作 者: 文艳玲 谢芝勋 黄琦 童桂香 刘加波 庞耀珊 邓显文 谢丽基
• 机 构: 广西兽医研究所,广西大学动物科技学院
• 出 处: 动物医学进展
• 发表日期: 2007年11期
• 关键词: 禽腺病毒1型和4型 抗原表位 同义密码子 偏爱性 AAV-1 andAAV-4 antigen epitope synonymous codon bias
• 基金项目: 新世纪百千万人才工程国家级专项资金支助（945200603）

为了研究禽腺病毒1型和4型（AAV-1和AAV-4）六邻体抗原表位和同义密码子的使用情况，运用生物学软件Antheprot5．0和EMBOSS的CHIPS、CUSP程序分别对AAV-1和AAV-4六邻体进行了分析，并将分析结果与大肠埃希菌、酵母及人的密码子偏爱性进行比较。结果显示，AAV-1、AAV-4六邻体的抗原表位区都主要集中在前段、中段，推测具有型和群特异性表位，可作为诊断型和群的首选蛋白。AAV-1和AAV-4六邻体的Enc值分别为43．553和38．475，在编码密码子使用频率上都存在明显差异，