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在儿童专科医院干细胞的应用仍以造血干细胞,特别是脐带血骨髓移植进行免疫重建为主。重庆医科大学附属儿童医院在2001年就与全国唯一一家以干细胞为主营业务的上市公司中源协和干细胞生物工程股份公司合作,建立了重庆市干细胞生物科研基地,并在重庆市科委的资助下,组建了干细胞治疗工程技术研究中心,成为国家干细胞与再生医学产业技术创新战略联盟的会员单位。