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区域创新绩效是考察区域创新系统运行状况的重要指标之一。本文尝试从动态的角度,利用数据包络分析法,对我国2000—2007年区域创新绩效进行实证分析,找出我国东中西部三大区域及各省市创新绩效的差异及发展趋势,提出了东部地区应充分利用创新资源和中西部地区要创新财力资源与人力资源、建立健全技术创新体系、营造鼓励创新的文化环境等建议。