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东杜斯秦铁铜矿位于博罗科努铜金钼铅锌铁磷硫铁矿成矿带，矿床主要分布于花岗闪长岩与呼独克达坂组灰岩的接触带部位形成的矽卡岩带中，矿床赋矿岩石为矽卡岩，矿化主要为磁铁矿化、黄铜矿化、黄铁矿化、镜铁矿化、闪锌矿化，地表见少量的褐铁矿化、孔雀石化；矿区接触交代变质作用发育，围岩蚀变主要为石榴石化、绿帘石化、大理岩化、碳酸盐化；矿床成因类型为典型的矽卡岩型矿床。