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通过DNA测序，分别对4个中国黄牛地方品种的MHC-Ⅱ类基因DRB3 外显子2的多态性进行分析。通过序列比对，共检测到DRB3＊exon2等位基因259种，其中新等位基因131个。等位基因的分布具有品种特异性。各等位基因之间存在大量多态位点，统计分析表明：发生非同义替换的多态位点均主要分布在抗原结合位点对应的编码序列中，共有17个变异位点的氨基酸组成在品种间具有显著差异，其中7个位点差异显著（P＜0.05）；10个位点差异极显著（P＜0.01）。在变异位点中，有8个位点为抗原结合位点。