【摘 要】
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为研究波罗蜜叶绿素缺失突变体(CDM)次生生长茎中抗病基因(PRGs)的变化,从转录组数据中筛选出9 630个PRGs.去除低丰度(FPKM≤0.5)后进行差异表达基因(DEGs)筛选,将2 513个DEG
【机 构】
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海南大学林学院,热带特色林木花卉遗传与种质创新教育部重点实验室,海口,570228;海南大学热带作物学院,海口,570228;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,农业部热带作物种质资源利用重点开
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为研究波罗蜜叶绿素缺失突变体(CDM)次生生长茎中抗病基因(PRGs)的变化,从转录组数据中筛选出9 630个PRGs.去除低丰度(FPKM≤0.5)后进行差异表达基因(DEGs)筛选,将2 513个DEGs进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),寻找到2个与表型关联性较高的模块,共183个DEGs.对模块基因进行GO功能注释、分类、转录因子(TFs)及类受体蛋白激酶(RLKs)分析.结果 显示,模块基因主要注释在结合(Binding)、细胞过程(Cellular process)和催化活性(Catalytic activity)等功能组.TFs分析显示,共有7个家族,14个转录因子.RLKs分析发现,RLK-Pelle-DLSV亚家族的12个DEGs中有11个在CDM中上调表达,说明该亚家族在波罗蜜CDM次生生长茎抵御逆境侵害过程中发挥着重要作用.本研究运用转录组测序数据分析波罗蜜CDM次生生长茎中PRGs的变化,为光合作用对木本植物茎响应逆境胁迫的研究提供数据.
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