基于TCGA数据库确定宫颈癌预后免疫相关性长链非编码RNA并构建预后模型

• 作 者: 底斐瑶 王一鹤 底泽亚 袁瑞
• 机 构: 重庆医科大学附属第一医院妇产科,郑州大学第一附属医院泌尿外科,北京大学信息科学技术学院
• 出 处: 世界最新医学信息文摘
• 发表日期: 2020年87期
• 关键词: 长链非编码RNA癌症基因组图谱 宫颈癌 免疫治疗 Long non-coding RNA The Cancer Genome Atlas Cervical Ca

目的通过TCGA(癌症基因组图谱)数据库确定与宫颈癌预后相关的免疫相关性LncRNA,并基于确定的免疫相关性LncRNA构建宫颈癌预后模型.方法从TCGA数据库中下载宫颈癌转录组及临床数据,从Molecular Signatures Database下载免疫相关基因,利用Strawberry Perl软件和R软件对数据进行处理和分析.首先构建免疫基因-LncRNA共表达网络,筛选免疫相关性LncRNA.通过单因素COX回归筛选出影响宫颈癌预后的免疫相关性LncRNA.再通过多因素COX回归分析构建预后模型