结核分枝杆菌北京基因型菌株大片段的多态性研究

来源 :中国防痨杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:compasion
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 揭示结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)北京基因型菌株的进化路径,在进化过程中产生的各个进化分支,以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况.方法 收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB菌株,首先采用多重PCR试验分析菌株基因组中差异片段207(RD207)的缺失情况,以鉴定收集的菌株是否为北京基因型;然后分析所有的北京基因型MTB菌株基因组中差异区域RD105、RD181、RD150和RD142的缺失情况,以及菌株基因组NTF(noise transfer function)区中插入序列6110(IS6110)的存在情况.结果 567株临床分离的MTB菌株中,517株(91.2%)为北京基因型菌株.所有北京基因型菌株中,447株(86.5%)为NTF区含有IS6110的北京基因型现代株;70株(13.5%)为NTF区不含IS6110的北京基因型古代株.基于大片段的多态性分析,北京基因型菌株被分为5个亚型,其中RD181(+)的北京基因型菌株为22株(4.3%),且全部为北京基因型古代株.RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的北京基因型古代株分别为41株(7.9%)和7株(1.4%).447株现代菌株中,RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的分别为404株(78.1%)和43株(8.3%).结论 MTB北京基因型中的现代株是天津地区的主要流行株;北京基因型MTB在人群传播流行中已经进化出5个分支,其中RD181(-)/RD150(+)的北京基因型现代株为主要的流行分支.“,”Objective To clarify the evolutionary pathway of Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis (MTB) and to elucidate the sublineages of Beijing strains.Methods The Beijing genotype isolates were identified from the 567 MTB isolates,which collected from the patients with pulmonary tuberculosis from Jan.2014 to Apr.2016 in Tianjin,China,by analyzing the deletion of regions of difference 207 (RD207).Large sequence polymorphism (LSP) of the Beijing strains were determined based on the presence or absence of RD105,RD181,RD150 and RD142.The insertion sequence 6110 (IS6110) insertion in noise transfer function (NTF) region was also analyzed.Results Of the 567 clinical isolates,517 (91.2%) were identified as Beijing genotype.Among these Beijing strains,447 (86.5%) belonged to modern Beijing strains that possessed IS6110 insertion in NTF region,whereas 70 (13.5%) belonged to ancient Beijing strains that had no IS6110 insertion in NTF region.Based on the LSP analysis,all 517 Beijing strains were further divided into five sublineages.22 (4.3%) were RD181 (+),and all these RD181(+) strains belonged to ancient Beijing genotype.41 (7.9%) and 7 (1.4%) were RD181(-)/RD150(+)and RD181(-)/RD150(-) ancient Beijing strain,respectively.Of the 447 modern Beijing strains,there were 404 RD181(-)/RD150(+) and 43 RD181(-)/RD150(-) strains,accounting for 78.1% and 8.3% of the Beijing isolates,respectively.Conclusion Modern Beijing strains are the most predominant in Tianjin,China.Based on the LSP analysis,the Beijing genotype strains have evolved five sublineages and the majority of isolates is the RD181(-)/RD150 (+) modern sublineage.
其他文献
迄今为止,氚的生物学效应研究已有60多年的历史.由于其在生物圈中的移动性和循环性特别强,并且可以与所有物质中的氢原子交换,其潜在的健康危害不容忽视.本篇综述主要回顾了
目的 分析白细胞介素2(IL-2)基因-330T/G和IL-6基因-174G/C多态性与结核病易感性的关系.方法 在Medline、PubMed、EMBase、Web of Science、Elsevier Science Direct、万方数
目的 了解利福平(R)、异烟肼(H)、乙胺丁醇(E)在我国结核病患者中的药代动力学特点,并探讨抗结核药物药代动力学参数与治疗疗效的相关性.方法 采用前瞻性研究方法,招募温州市
目的 探讨中国核电厂操纵人员的决策能力及其相关性分析.方法 采用整群抽样法,在国内七座核电站随机选取500名操纵人员,应用苏州大学附属第二医院自主研究开发的《中国核电厂
目的 研究温州市耐多药肺结核患者队列标准化疗方案的治疗转归,并分析其影响因素.方法 搜集2013年8月至2015年12月筛查确诊的耐多药肺结核患者198例,其中,10例患者拒绝接受治
过敏性疾病的发病率在世界范围内逐年增长,已成为全国乃至全球的重点防治疾病之一,但至今,此病仍无有效的治疗措施.对于儿童来说,过敏的病症主要有湿疹、过敏性鼻炎、哮喘、
肺结核是一种严重危害人类健康、威胁人类生命的慢性呼吸道传染病.做好公众结核病知识教育和行为干预对减少新发肺结核患者、降低肺结核的传染率具有重要意义.通过查阅与复习
目的 分析2015-2019年嘉兴市急诊儿童意外伤害原因及特点.方法 收集2015-2019年该院收治的300例意外伤害儿童的病例资料,录入年龄、性别、受伤地点、受伤类型、受伤部位等资
目的 探讨中国核电厂操纵人员的创造力与人际关系的规律,为中国核电厂操纵人员的选拔、岗位健康适应性评价、指导职业培训、心理干预以及用人单位规避人因风险提供依据.方法