【摘 要】
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目的:探讨转录因子二聚化配体(transcription factor dimerization partner,TFDP)家族成员在多种恶性肿瘤中的表达情况及其与癌症患者临床预后的相关性并筛选出针对癌症组织中TFDP家族基因表达具有敏感性的药物.方法:应用TCGA数据库和UCSC数据库挖掘TFDP家族基因表达数据以及癌症患者对应的临床数据,通过R语言软件统计分析TFDP家族基因在多种恶性肿瘤中的表达情况以及和癌症患者生存预后的相关性.应用CellMiner数据库挖掘不同癌症中药物与基因表达相关性的数据.
【机 构】
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北京大学基础医学院免疫学系,北京 100191
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目的:探讨转录因子二聚化配体(transcription factor dimerization partner,TFDP)家族成员在多种恶性肿瘤中的表达情况及其与癌症患者临床预后的相关性并筛选出针对癌症组织中TFDP家族基因表达具有敏感性的药物.方法:应用TCGA数据库和UCSC数据库挖掘TFDP家族基因表达数据以及癌症患者对应的临床数据,通过R语言软件统计分析TFDP家族基因在多种恶性肿瘤中的表达情况以及和癌症患者生存预后的相关性.应用CellMiner数据库挖掘不同癌症中药物与基因表达相关性的数据.用Western blot方法验证TFDP3在多种恶性肿瘤细胞系中的表达情况.结果:TFDP1和TFDP2基因在癌症中的整体表达量高于TFDP3.TFDP1在多种恶性肿瘤中表达上调.TFDP1和TFDP2在癌症中的表达具有正相关的关系,TFDP1和TFDP3的表达具有微弱负相关的关系.进一步发现,TFDP1和TFDP2基因的表达在多种恶性肿瘤中和患者的生存预后具有显著相关性.并且TFDP家族基因在癌症中的表达也与肿瘤免疫亚型的分型均具有相关性.在肿瘤微环境中,TFDP家族基因的表达与免疫细胞和基质细胞的打分多呈负相关,与肿瘤干细胞打分多呈正相关.最后,我们筛选出了一些对TFDP家族基因在癌症中的表达具有敏感性的药物.结论:TFDP家族基因对癌症的发生发展具有重要的意义,其表达和癌症患者的生存预后有显著的相关性.一些对TFDP家族基因在癌症中表达具有敏感性的药物可以作为治疗癌症的潜在药物.
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