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昌吉国家农业科技区是国家科技部2002年批准的全国36个农业科技园区之一，目前已形成了瓜菜等农作物制种、啤酒花原料、绿色果蔬生产、粮油加工等优势产业和以“西域”系列为品牌的主导产业品。其中瓜菜等农作物制种已成为在一定范围内带动区域经济发展的支柱产业之一，昌吉州由此成为全国重点的瓜菜制种基地之一。