基于层级规则树的跨平台基因表达数据分类

• 作 者: 蔡瑞初 侯永杰 郝志峰
• 机 构: 广东工业大学计算机学院,佛山科学技术学院数学与大数据学院
• 出 处: 计算机工程
• 发表日期: 2019年7期
• 关键词: 数据分类 跨平台 规则学习 特征选择 基因表达数据 data classification cross-platform rule learning featu
• 基金项目: 国家自然科学基金(61472089),NSFC-广东联合基金(U1501254),广东省自然科学基金(2014A030306004,2014A030308008),广东省科技计划项目(2015B010108006,2015B010131015),广东特支计划(2015TQ01X140),广州市科技计划项目(201604016075),广州市珠江科技新星专项(201610010101)

基因检测技术运用至今已积累大量来自不同平台的数据,针对传统数据分类模式难以在不同平台间进行有效迁移的问题,提出一种基于层级规则树的基因表达数据分类算法k-HRT。设计数据转换与规则预筛选策略,实现算法的快速挖掘,以解决由跨平台特性所带来的大规模数据问题。在真实基因表达数据集上的实验结果表明,相对k-TSP算法、SVM-RFE算法,k-HRT算法能够有效提高分类精度。