【摘 要】
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目的了解2013年华东地区活禽市场分离的一株H9N9亚型禽流感病毒(命名为:A/chicken/Changzhou/C08/2013)的分子特征,探讨该病毒的出现对新型H7N9亚型禽流感病毒防控的意义。方
【机 构】
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江苏省疾病预防控制中心卫生部肠道病原微生物重点实验室;
【基金项目】
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国家“十二五”艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项(2012ZXl0004-210-004);江苏省自然科学基金(BK20141030);江苏省333人才项目(BRA2013285)
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目的了解2013年华东地区活禽市场分离的一株H9N9亚型禽流感病毒(命名为:A/chicken/Changzhou/C08/2013)的分子特征,探讨该病毒的出现对新型H7N9亚型禽流感病毒防控的意义。方法采用高通量测序技术对该分离株进行全基因组测序,MEGA6.0软件进行序列比对,采用邻近归并法(neighbor-joining)构建系统发生树进行基因特征分析。结果 A/chicken/Changzhou/C08/2013血凝素基因(HA)与上海鸡分离株A/chicken/Shanghai/1107/2013(H9N2)的核苷酸一致性最高(99.2%),其HA基因裂解基序为VPSRSSR↓GLF,呈典型低致病性禽流感病毒(AIV)分子特征;其余的基因则与新型H7N9亚型禽流感病毒的同源性较高(>99.6%)。结论推测该H9N9病毒是由H9N2亚型AIV与新型H7N9亚型AIV发生重配的新型病毒,其HA基因来源于为H9N2亚型AIV,其他基因来源于新型H7N9亚型AIV,结果提示新型H7N9亚型AIV正在与禽中流行的其他亚型AIV进行重组,需要加强对AIV的持续监测。
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