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为分析二马牙和长脖类型林下参不同组织中人参皂苷含量存在差异的分子机制,测量同一环境下14年生两种林下参表型及人参皂苷含量,利用高通量测序技术对两种类型林下参的叶片、芦头及主根进行转录组测序,筛选差异表达基因,并对芦头的7个差异基因进行了qRT-PCR验证。表型分析结果表明,与长脖相比,二马牙芦头短粗、须根发达、根部及地上部分均更粗壮、产量高。转录组分析结果显示,2种类型林下参叶片、芦头、主根中分别有124、604、89个差异基因,上调基因分别有48、283、31个,下调基因分别有76、321、58个;通过