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天蓝苜蓿（Medicago lupulina）隶属于苜蓿属，是一年生或越年生、广布的草本植物。通常认为它是自交种，但也有些研究报道它具有异交或者混合交配的繁育系统。为了了解它的居群遗传变异、基因流、繁育方式及其遗传背景，我们用9个EST—SSR标记分析了中国新疆、内蒙古、甘肃、北京、山西、陕西、湖北7个省区的17个天蓝苜蓿野生居群。结果表明：（1）EST—SSR的多态位点百分率（PPL）为71．9％；每个SSR位点的等位基因数似）为4-11（平均为7．333）；遗传多样性（HE）最高的居群是新疆那拉提（0