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分子生态学为堆肥微生物的研究提供了新的技术手段，DNA的提取是该技术的基础，但由于腐殖酸类物质的污染，增加了堆肥微生物总DNA的提取难度．采用了3种不同的方法（溶菌酶法、超声波破碎法和蛋白酶K—CTAB法）从堆肥中提取微生物的总DNA，使用核酸和蛋白质分析仪检测后表明3种提取方法获得的DNA产量均较高；琼脂糖凝胶电泳结果表明其长度约为23kb；使用细菌16SrRNA基因通用引物（27F和1495R）对总DNA进行PCR扩增，都获得了几乎全长的16SrDNA序列（约1．5kb）；利用限制性内切酶（HaeⅢ和