In Silico Screening for Microsatellite Markers from Expressed Sequence Tags of Porphyra yezoensis （B

• 作 者: WANG Mengqiang HU Jingjie ZHUA
• 机 构: CollegeofMarineLifeScience
• 出 处: 中国海洋大学学报：英文版
• 发表日期: 2007年2期
• 关键词: 条斑紫菜 表达序列标签 微卫星标记 虚拟筛选 bioinformatics data mining EST microsatellites Porphyr
• 基金项目: We thank all the laboratories that deposited P. yezoensis EST sequences to the dbEST database at NCBI, on which our study was based. We thank Mrs. Cuddihy, Mr. Cuddihy and Prof. Yang Guanpin for their

表示顺序标注的 Porphyra yezoensis (EST ) 的 genomic 资源被利用识别简单顺序重复(SSR ) ，或微卫星。这个方法拿了为基因身份的建立或为高多型性的获得使用 EST 和微卫星的优点。当基因标记 whenmicrosatellites 被附在基因，微卫星能被使用。由生物信息学分析揭示了， 1 162 从 21 954 颗 ESTscontained 微卫星和聚合分析显示 984 这些 EST 掉进 112contigs，当另外的 178 EST 是单条时。290 唯一的包含