【摘 要】
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目的:基于生物信息学进行数据挖掘以探讨UHRF1在胰腺癌中的表达情况及对胰腺癌患者预后的影响.方法:使用GEPIA数据库探索UHRF1在泛癌中的表达模式.应用Kaplan-Meier Plotter
【机 构】
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武汉大学人民医院内分泌科,湖北 武汉 430060;武汉大学人民医院妇产科 湖北 武汉 430060
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目的:基于生物信息学进行数据挖掘以探讨UHRF1在胰腺癌中的表达情况及对胰腺癌患者预后的影响.方法:使用GEPIA数据库探索UHRF1在泛癌中的表达模式.应用Kaplan-Meier Plotter分析UHRF1对胰腺癌患者预后的意义.使用UCGA Xena制作热图分析UHRF1的表达水平、甲基化状态和拷贝数变异对胰腺癌患者预后的影响.筛选TCGA数据库和GEO数据库(GSE43795数据集)胰腺癌中UHRF1共表达基因,并应用Metascape进行基因功能富集分析.结果:UHRF1在大部分癌症中差异表达;和正常胰腺组织相比,胰腺癌组织UHRF1表达量显著升高(P＜0.01).Kaplan-Meier Plotter数据平台显示UHRF1高表达显著影响胰腺癌患者预后,其中高、低表达组中位生存期分别为16.6个月和23.17个月(HR=2.03,95％可信区间1.34～3.06,P=0.000 58).使用UCGA Xena平台对来自TCGA数据库的178个胰腺癌数据进行分析显示,UHRF1mRNA表达水平和胰腺癌患者预后相关,但甲基化状态以及拷贝数变异和胰腺癌患者的总生存率没有明显相关性.通过分析得出UHRF1与KIF11、KIF23、RRM2、ERCC6L和MELK等基因具有共表达关系,并且富集分析显示UHRF1共表达基因与细胞核分裂以及细胞周期相变等密切相关.在HPA数据库中分析胰腺肿瘤组织与正常组织UHRF1的免疫组化染色结果,显示UHRF1蛋白在正常胰腺组织中未检测到,而在胰腺癌组织中高表达.结论:胰腺癌组织中UHRF1基因表达水平显著上调,且UHRF1过表达对胰腺癌患者预后不利,UHRF1可能通过参与细胞核分裂以及细胞周期等过程实现对胰腺癌的影响.UHRF1可能作为胰腺癌预后的重要预测指标,并有潜力成为胰腺癌治疗的靶标.
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