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目的:对巴彦淖尔地区进行汉坦病毒的分子流行病学调查.方法:采用间接免疫荧光法(IFA)对在野外捕获的鼠肺样品进行初筛,用逆转录-聚合酶链式反应(RT—PCR)扩增IFA阳性标本中汉坦病毒的S基因片段,以S基因片段(620—999nt)的核苷酸序列构建系统发生树并进行分子进化分析.结果:捕获的200只中有褐家鼠141只(70.5%),黑线仓鼠40只(20.0%),小家鼠19只(9.5%);IFA检出6份阳性标本,均来自褐家鼠,其S基因均为S1亚型.结论:巴彦淖尔地区褐家鼠携带S1亚型汉坦病毒.